• В апреле 1993 года НК НПЗ стал акционерным обществом в составе нефтяной компании ЮКОС.
• В 1995 году введена установка селективной очистки масел (УСОМ) по лицензии фирмы "Тексако". Мощность, построенная по проекту и на оборудовании английской фирмы "Бабкок Контракторс Лимитед", позволила
улучшить качество масел и экологическую обстановку на промышленной площадке и в городе Новокуйбышевске.
• В 1995 году за три с половиной месяца бывшую установку АВТ-10 перевели на выпуск получения пара, а на месте старой установки 35-5 построили котельную, которые обеспечили технологические установки завода на
половину собственным паром. Таким образом, заметно снизилась острота энергетической проблемы.
• В 1996-1997 годах ускоренными темпами построена собственная теплоэнергетическая станция (ТЭС) с шестью паровыми котлами, мощностью по 60 тонн пара в час каждый. Зиму 1997 года завод впервые за всю историю
проработал на собственной тепловой энергии, имея в арсенале мощную современную ТЭС с автоматизированной системой управления технологическим процессом, что позволило снизить стоимость переработки нефти на
15 процентов.
• В марте 1996 года завод перешел на выплату заработной платы по магнитным карточкам Сбербанка РФ.
• В 1996-1997 годах были модернизированы установки каталитического риформинга 35-6, 35-8, 35-11-300, что позволило вырабатывать компоненты высокооктановых неэтилированных бензинов. С августа 1997 года ОАО НК
НПЗ полностью перешло на выпуск неэтилированных бензинов.
• В 1997 году построена и пущена вторая очередь товарно-сырьевой базы - три резервуара по 20 тысяч тонн каждый, а всего их на ТСБ шесть.
1 июля 1998 года из бывших производств ОАО НК НПЗ образовалось дочернее предприятие - Новокуйбышевский завод масел и присадок (НЗМП).

• Сегодня более 30 видов продукции ОАО НК НПЗ отгружается во все концы страны и за рубеж по железной дороге, трубопроводным транспортом и по Волге, благодаря удобному географическому расположению в центре России. Нефть поступает для переработки как с местных месторождений, так и по магистральным нефтепроводам из Юганска, Оренбурга и других месторождений.

• В 1998 году ОАО НК НПЗ награждено Международным призом "Лидер российской промышленности-98" и Сертификатом участника Программы "Партнерство ради прогресса