• 1999 год стал годом реструктуризации предприятия. Из его состава вы делились сервисные службы - ремонтная, энергетическая, контроля и автоматики, природоохранная.

• 2000 год - начало реализации крупной инвестиционной программы Компании в ОАО НК НПЗ, направленной на модернизацию производства,повышение конкурентоспособности предприятия, восстановление кооперации между Куйбышевским и Новокуйбышевским НПЗ.

• Новокуйбышевский НПЗ, являясь градообразующим предприятием,оказывает посильную поддержку важнейшим социальным городским программам. В частности, является участником областной комплексной программы экологического оздоровления территории города; совместно с НК ЮКОС участвует в долевом строительстве городской станции обеззараживания стоков, а также в образовательных программах, таких, как "ЮКОС-класс", "Новая цивилизация", учреждение премий победителям городских школьных олимпиад и пр.

• С июля 2000 года ОАО НК НПЗ возглавляет генеральный директор Андрей Алексеевич Коновалов.

• В 2000 году ОАО НК НПЗ получил Международные награды:
- по результатам аналитических исследований, проведенных экспертами международной Ассоциации "Австралиана Дискавери Маркет" ("АДМ Бизнес Консалтинг"), ее Учредительный Совет наградил ОАО НК НПЗ призом "Предприятие года-2000" с вручением номерногоподтверждающего сертификата;
- диплом Ассоциации "Компании XXI века" вручил Президент European Contrasts" по результатам анализа работы в 2000 году;
- генеральный директор ОАО НК НПЗ АА. Коновалов за профессионализм управления удостоился Золотой медали и Диплома "Бизнес-лидер-2000".

• 1- 2 сентября 2001 года завод отмечает свое 50-летие. Празднование приурочено к Дню нефтяника.